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微卫星DNA标记应用前景

2016-09-08 13:59:19  字体:   打印 收藏 

摘 要:标题:微卫星DNA标记应用前景 作者:钱** 论文内容:分子标记是以个体之间的遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平上遗传多态性的直接的反映。微卫星标记是继RFLP、AFLP之后的一种新的遗传标记。微卫星标记已被广泛应用于保护遗传学研究的各

关键词:钱**微卫星DNA标记*前景


  标题:微卫星DNA标记应用前景

  作者:钱**

  论文内容:分子标记是以个体之间的遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平上遗传多态性的直接的反映。微卫星标记是继RFLP、AFLP之后的一种新的遗传标记。微卫星标记已被广泛应用于保护遗传学研究的各个领域,包括种群遗传多样性评估、种群遗传结构分析、遗传图谱构建、基因定位和亲子鉴定等。

  1 微卫星标记的发现 20世纪70年代,生物科学家Litt[1]等在研究寄居蟹基因组DNA时发现其基因组中存在许多不同碱基的重复序列。在后续研究中,发现人、动物和酵母基因组中均存在大量类似的重复单元并于1988年将此重复序列作为新的遗传标记并应用于人类,创造出“微卫星”(Microsatellite)的名称。

  2 微卫星的结构 微卫星又称简单重复系列(Simple Sequence Repeats,SSR)或简单串联重复序列多态性(Short Tandem Repeat Polymorphism,STRP),这些位点由短的重复串联序列(1~6 bp)组成。这些微卫星序列广泛分布于基因组中,其重复次数以及重复程度在不同生物及个体之间呈现高度多态性。依据微卫星核心序列的排列方式将微卫星分为3大类,完全重复(无间隔),不完全重复(间隔序列存在于重复单元中)和复合型(2个以上重复单元)。

  3 微卫星的筛选 目前,获得微卫星DNA的方法有3种。一是通过构建基因组文库,标记核心重复序列作为探针,与基因组文库进行杂交筛选,然后测序进而设计特异性引物等步骤;二是利用近缘物种DNA序列的同源关系,通过已知的微卫星引物跨种使用,进而筛选到适合新物种的微卫星DNA标记;三是利用高通量测序,构建文库,利用生物信息学知识进行大面积筛选。目前随着基因组计划的全面展开,三大DNA数据库Genebank、EMBL、DDJB收录的数据越来越多,通过检索比对将更容易获取更多的微卫星标记。

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  状态:《电子科技已审稿

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